سیستماتیک ملکولی قبیله hedysareae با تاکید ویژه بر جنس onobrychis براساس توالی های nrdnaits و trnl-f کلروپلاستی
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه
- author عاطفه امیراحمدی
- adviser شاهرخ کاظم پور اوصالو علی اصغر معصومی
- Number of pages: First 15 pages
- publication year 1389
abstract
بعد از دکاندول حدود تاکسونومیک قبیله hedysareae متحمل تغییرات فراوانی شده است. lock (2005) این قبیله را به 12 جنس شامل corethrodendron، ebenus، eversmannia، hedysarum، onobrychis، sartoria، sulla، taverniera، alhagi، calophaca، caragana و halimodendron گسترش داد. اعضای قبیله hedysareae عضو irlc و گروه علفی های معتدله بوده و بطور کلی در مکانهای باز خشک یا مناطق مدیترانه ای و حاره ای یافت می شوند. در پژوهش حاضر، به منظور بازسازی روابط فیلوژنی 91 تاکسون (79 گونه در آنالیز nrdna its، 72 گونه در آنالیز trnl-f و 77 گونه در آنالیز ترکیبی) شامل 62 تاکسون از hedysareae به همراه 9 گونه از کلاد astragalean و 9 گونه از کلاد caraganean به عنوان درون گروه به اضافه 10 گونه از کلاد vicioid به همراه glycyrrhiza glabra (از galegeae) به عنوان برون گروه انتخاب شدند. آنالیزهای فیلوژنی با استفاده از روش بیشینه صرفه جویی(maximum parsimony) تعبیه شده در نرم افزار paup* و روش bayesian در نرم افزارmrbayes صورت گرفت. آنالیزهای ما همراه با مطالعات ملکولی اخیر نظر lock (2005) را تایید نکرد. calophaca، caraganaو halimodendron از قبیله galegeae ارتباط خویشاوندی نزدیکی با قبیله hedysareae ندارند. این جنس ها به همراه chesneya، gueldenstaedtia یک کلاد مجزا را (caraganean clade) تشکیل می دهند. hedysareae در اینجا فقط مشتمل بر alhagi، corethrodendron، ebenus، eversmannia، hedysarum، onobrychis، sartoria، stracheya، sulla و taverniera تعیین حدود می شود. بازسازی فیلوژنی تمامی آنالیزها تایید کرد که alhagi به خوبی با بقیه اعضای کلاد hedysaroid متحد شده است. نمایندگانی از جنس sulla به همراه h. humile و h. aculeolatum گروه تک تباری با حمایت بالا را تشکیل دادند. بنابراین این دو گونه باید تحت عناوین sulla humilis و sulla aculeolata به جنس sulla منتقل شوند. جنس های taverniera و ebenus هر دو تک تبار اند. hedysarum قطعا پیراتبار است. جنس تک گونه ای sartoria، بومی ترکیه، بین گونه های hedysarum قرار گرفته است. همچنین stracheya، جنس تک گونه ای و بومی تبت،(تنها با توالی یابی ناحیه trnl-f) در یک کلاد با گونه های hedysarumقرار گرفته است. تک تباری جنس onobrychis (ناشی از هموپلازی و نمونه برداری زیاد گونه ها) توسط این داده ها حمایت نشده است; اما در آنالیز محدود با یک نماینده از هشت بخشه، ثابت شد که این جنس تک تبار است. onobrychis زیرجنس onobrychis و تمامی بخشه های آن (بجز بخشه laxiflorae که دارای یک نماینده در این مطالعه است) به نظر می رسد پیراتبار باشند. اما onobrychis زیرجنس sisyrosema و بخشه های afghanicae و heliobrychis تک تباراند. اعضای بخشه های anthyllium و hymenobrychis (هر دو از زیرجنس sisyrosema) با یکدیگر مخلوط شده و یک پلی تومی با حمایت بالا را تشکیل داده اند. corethrodendron و eversmannia نیز خویشاوند نزدیک هم بوده و ارتباط نزدیکی با onobrychis دارند. جدائی corethrodendron از hedysarum توسط آنالیزهای ما تایید شد. pcr و توالی یابی dna در کل ناحیه trnl-f آشکار کرد که در دو گونه hedysarum مربوط به شمالگان، h. alpinum) و h. boreale ) اینترون trnluaa بطور کامل از دست رفته است. این یافته اولین گزارش برای فقدان این اینترون در گیاهان خشکی است.
similar resources
فیلوژنی مولکولی قبیله hedysareae با تأکید ویژه بر جنس onobrychis بر اساس توالی های nrdna its
تعداد 53 گونه (54 توالی) شامل 28 گونه از قبیله hedysareae، 5 گونه از کلاد vicioid و 19 گونه از قبیله galegeae از جمله دو گونه glycyrrhiza به عنوان برون گروه با استفاده از توالی های nrdna its در آنالیز فیلوژنی با روش بیشینه صرفه جویی قرار گرفت. آنالیز براساس وزن دهی مجدد پی درپی با شاخص سازگاری تصحیح شده فاش نمود که کلاد vicioid اولین شاخه ای است که بدنبال آن کلاد chesneya-caragana و کلاد astrag...
full textفیلوژنی مولکولی قبیله Hedysareae با تأکید ویژه بر جنس Onobrychis بر اساس توالیهای nrDNA ITS
تعداد 53 گونه (54 توالی) شامل 28 گونه از قبیله Hedysareae، 5 گونه از کلاد Vicioid و 19 گونه از قبیله Galegeae از جمله دو گونه Glycyrrhiza به عنوان برونگروه با استفاده از توالیهای nrDNA ITS در آنالیز فیلوژنی با روش بیشینه صرفهجویی قرار گرفت. آنالیز براساس وزندهی مجدد پیدرپی با شاخص سازگاری تصحیح شده فاش نمود که کلاد Vicioid اولین شاخهای است که بدنبال آن کلاد Chesneya-Caragana و کلاد Astrag...
full textسیستماتیک ملکولی قبیله hedysareae در ایران
پژوهش حاضر به بررسی سیستماتیک ملکولی قبیله hedysareae می پردازد. در بخش نخست این بررسی به منظور تعیین حدود قبیله، 57 تاکسون (59 نمونه) در آنالیز nrdna its و trnl-f و 56 تاکسون در آنالیز matk و آنالیز ترکیبی شامل تمامی جنس هایی که تاکنون به نحوی با قبیله ارتباط داشتند و همچنین خویشاوندان نزدیک آن مورد ارزیابی قرار گرفتند. گونه glycyrrhiza glabra در تمامی آنالیزها به عنوان برون گروه انتخاب شد. در...
15 صفحه اولفیلوژنی مولکولی جنس ( Rochelia (Boraginaceae بر اساس توالی های nrDNA ITS و cpDNA trnL-F
تعداد 8 گونه از جنس Rochelia و دو گونه از Lappula (به عنوان برون گروه) با استفاده از توالی هستهای ITS و توالی کلروپلاستی trnL-F به طور جداگانه و نیز به صورت ترکیبی آنالیز شدند. برای مشخص کردن روند تکامل صفات مورفولوژیکی، شش صفت تشخیصی بر روی درخت ترکیبی با استفاده از برنامه MacClade 4 نشان داده شد. آنالیز ها آشکار کرد که بخشه Rochelia به دلیل قرار گرفتن بخشه مونوتیپیک Cryptocarpa (Rochelia c...
full textفیلوژنی مولکولی بخشه acanthophace از سرده گون (fabaceae) بر اساس توالی هسته ای nrdnaits و توالی کلروپلاستی rpl32-trnl(uag)
سرده گون (astragalus) از تیره fabaceae با حدود 3000-2000 گونه و 245 بخشه بزرگ¬ترین سرده در میان گیاهان گلدار است. گون¬های خاردار گروه نسبتاً بزرگی از این سرده را تشکیل می-دهند. بخشه acanthophace به عنوان گروه پایه¬ای در گون¬های خاردار شامل10-9 گونه می¬باشد که 7 گونه انحصاری ایران می¬باشند. در پژوهش حاضر به منظور بازسازی روابط فیلوژنی 42 تاکسون (17 نمونه متعلق به 10 گونه از بخشهacanthophace و 23 ...
15 صفحه اولسیستماتیک مولکولی جنس ebenus (fabaceae-hedysareae) براساس توالی هایnrdna its و matk
چکیده ebenus در مناطق جنوب غرب آسیا، شرق مدیترانه و شمال آفریقا گسترش یافته است وحدوداً شامل 19 گونه است. در مطالعه حاضر، 31 تاکسون (31 گونه در آنالیز nrdna its، 25 تاکسون در آنالیز matk و 25 گونه در آنالیز ترکیبی) شامل 18 گونه از ebenus، 6 گونه از taverniera، 2 گونه از جنس onobrychis و دو گونه از جنس hedysarum به عنوان درونگروه و بعلاوه alhagi persarum به عنوان برونگروه در بازسازی فیلوژنی انتخ...
15 صفحه اولMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023